Das Logo des Medizinhistorischen Museums wurde vom Senat der Warschauer Medizinischen Universität in seiner Sitzung am 22. April 2013 genehmigt. Auf dem Logo sind der Äskulapstab und die ersten Wörter des griechischen Zitats Hippokrates auf Latein: „Ho bios brachys, he de techne makre…“ abgebildet.
Das vollständige Zitat in der Übersetzung lautet: „Das Leben ist kurz, die Kunst dagegen lang, der günstige Augenblick ist flüchtig, die Erfahrung unsicher, das Urteil schwierig“ und deutet an, dass das Leben eines Menschen nicht ausreicht, um die Kunst der Medizin zu ergründen. Dazu wird die Arbeit von mehreren Generationen benötigt.